Lompat ke konten Lompat ke sidebar Lompat ke footer

Ilmuwan Mengungkap Detail Struktural tentang Bagaimana Varian SARS-CoV-2 Meloloskan Diri dari Respons Kekebalan Tubuh

Varian virus corona penyebab COVID-19 yang menyebar dengan cepat, SARS-CoV-2, membawa mutasi yang memungkinkan virus melarikan diri dari beberapa respons kekebalan yang dibuat secara alami atau dengan vaksinasi. Sebuah studi baru dari para ilmuwan di Scripps Research, bersama dengan kolaborator di Jerman dan Belanda, telah mengungkapkan rincian kunci tentang cara kerja mutasi pelarian ini.
IMAGES
Gambar: www.news-medical.net

Para ilmuwan, yang studinya muncul di Science , menggunakan teknik biologi struktural untuk memetakan pada resolusi tinggi seberapa penting kelas antibodi penawar mengikat ke strain pandemi asli SARS-CoV-2 - dan bagaimana prosesnya terganggu oleh mutasi yang ditemukan pada varian baru. pertama kali terdeteksi di Brasil, Inggris Raya, Afrika Selatan, dan India.

Penelitian ini juga menyoroti bahwa beberapa dari mutasi ini berkumpul di satu tempat, yang dikenal sebagai "situs pengikatan reseptor," pada protein lonjakan virus. Situs lain di domain pengikat reseptor tidak terpengaruh.

"Implikasi dari penelitian ini adalah bahwa, dalam merancang vaksin generasi mendatang dan terapi antibodi, kami harus mempertimbangkan untuk meningkatkan fokus pada situs rentan lainnya pada virus yang cenderung tidak terpengaruh oleh mutasi yang ditemukan dalam varian yang menjadi perhatian," kata rekan. -Penulis utama Meng Yuan, PhD.

Yuan adalah rekan penelitian pascadoktoral di laboratorium penulis senior Ian Wilson, DPhil, Profesor Biologi Struktural Hansen dan Ketua Departemen Biologi Struktural dan Komputasi Integratif di Scripps Research.

Bagaimana 'varian perhatian' lolos dari respons imun

"Varian yang menjadi perhatian" SARS-CoV-2 mencakup varian B.1.1.7 Inggris, varian B.1.351 Afrika Selatan, varian P.1 Brasil, dan varian B.1.617 India. Beberapa dari varian ini tampaknya lebih menular daripada strain asli Wuhan. Studi terbaru menemukan bahwa respon antibodi yang dihasilkan melalui infeksi alami terhadap strain asli atau melalui vaksinasi kurang efektif dalam menetralkan strain varian ini.

Karena potensi varian untuk menyebar dan menyebabkan penyakit - mungkin dalam beberapa kasus, meskipun telah divaksinasi - para ilmuwan menganggap penting untuk menemukan bagaimana varian tersebut berhasil lolos dari banyak respons kekebalan sebelumnya di dalam tubuh, termasuk respons antibodi.

Dalam studi tersebut, para peneliti berfokus terutama pada tiga mutasi pada lonjakan protein SARS-CoV-2: K417N, E484K dan N501Y. Sendiri atau dalam kombinasi, mutasi ini ditemukan di sebagian besar varian SARS-CoV-2 utama. Semua mutasi ditemukan di situs pengikatan reseptor SARS-CoV-2, tempat virus menempel pada sel inang.

Para peneliti menguji antibodi perwakilan dari kelas utama yang menargetkan area umum di dalam dan sekitar situs pengikatan reseptor. Mereka menemukan bahwa banyak dari antibodi ini kehilangan kemampuannya untuk mengikat dan menetralkan virus secara efektif saat mutasi muncul.

Dengan menggunakan teknik pencitraan struktural, tim kemudian memetakan bagian yang relevan dari virus pada resolusi skala atom untuk memeriksa bagaimana mutasi memengaruhi situs di mana antibodi akan mengikat dan menetralkan virus.

"Pekerjaan ini memberikan penjelasan struktural mengapa antibodi yang ditimbulkan oleh vaksin COVID-19 atau infeksi alami oleh jenis pandemi asli seringkali tidak efektif melawan varian yang menjadi perhatian ini," kata Wilson.

Memusatkan perhatian pada titik-titik kerentanan

Temuan ini menunjukkan bahwa sementara tanggapan antibodi terhadap situs pengikatan reseptor SARS-CoV-2 bisa sangat kuat dalam menetralkan strain asli Wuhan, varian tertentu dapat lolos - mungkin pada akhirnya memerlukan vaksin yang diperbarui.

Pada saat yang sama, penelitian tersebut menggarisbawahi fakta bahwa tiga mutasi virus utama, yang tampaknya cenderung berkembang oleh SARS-CoV-2, tidak mengubah situs rentan lainnya pada virus di luar situs pengikatan reseptor. Para peneliti secara khusus menunjukkan bahwa antibodi penawar virus yang menargetkan dua area lain di luar situs pengikatan reseptor sebagian besar tidak terpengaruh oleh ketiga mutasi ini.

Ini menunjukkan bahwa vaksin masa depan dan perawatan berbasis antibodi dapat memberikan perlindungan yang lebih luas terhadap SARS-CoV-2 dan variannya dengan memunculkan atau memanfaatkan antibodi terhadap bagian-bagian virus yang berada di luar situs pengikatan reseptor. Para peneliti mencatat bahwa perlindungan luas terhadap varian mungkin diperlukan jika, seperti kemungkinan besar, virus menjadi endemik pada populasi manusia.

Laboratorium Wilson dan kolaborator dalam penelitian ini terus mempelajari tanggapan antibodi manusia terhadap varian yang menjadi perhatian dan berharap dapat mengidentifikasi strategi perlindungan yang luas terhadap tidak hanya SARS-CoV-2 dan variannya tetapi juga SARS-CoV-1 dan terkait lainnya, yang muncul. virus corona.

Studi, "Konsekuensi struktural dan fungsional dari antigenic drift pada varian SARS-CoV-2 baru-baru ini" ditulis oleh Meng Yuan, Deli Huang, Chang-Chun Lee, Nicholas Wu (penulis bersama), dan oleh Abigail Jackson, Xueyong Zhu , Hejun Liu, Linghang Peng, Marit van Gils, Rogier Sanders, Dennis Burton, S. Momsen Reincke, Harald PrĂ¼ss, Jakob Kreye, David Nemazee, Andrew Ward dan Ian Wilson.

Powered By NagaNews.Net